| 一个生态群落的多样性，有两个基本的指标。
另外还有个名词是丰度（abundance），是每个物种数量的表征，衡量生态群落的基本元素 举个离子，假设以财富为研究对象。 A地区有甲乙丙三个人，甲有1元钱，乙有2元钱，丙有1.5元钱 B地区有丁戊己三个人，丁有1元钱，戊有100元钱，己有1个亿 那么A和B两个地区的财富丰富度是一样的，都等于3；但是均匀度是不同的，因为B地区的贫富差距要远大于A地区，所以A地区的均匀度要高于B地区。 言归正传，再来个例子； A地：牛10头，马10匹，羊10只 B地：牛2头，马100匹，羊1000只 C地：牛5头，马5匹，羊5只 Shannon的计算方法是
每个地区的Shannon指数H H(A) = -(1/3 * ln(1/3) + 1/3 * ln(1/3) + 1/3 * ln(1/3)) = 1.098612 H(B) = 0.3116287 H(C) = 1.098612 Simpson的计算方法是 n：每个物种的数量；N：某个地区/样本中的所有物种数量 D(A) = 0.3103448；D(B) = 0.8330443; D(C) = 0.2857143 Pielou的计算方法是 H：就是上面计算的Shannon指数 S：species richness，每个物种的丰富度 J(A) = 1; J(B) = 0.2836567; J(C) = 1 总的来说：
R代码如下： a <- c(10, 10, 10)b <- c(1, 100, 1000) c <- c(5, 5, 5) Shannon.H <- function(spe_vec){ rela <- spe_vec / sum(spe_vec) plnp <- sum(rela * log(rela, base = exp(1))) return(-plnp) } Shannon.H(a) Shannon.H(b) Shannon.H(c) Simpson.D <- function(spe_vec){ return(sum(spe_vec * (spe_vec - 1)) / (sum(spe_vec) * (sum(spe_vec) - 1))) } Simpson.D(a) Simpson.D(b) Simpson.D(c) Pielou.J <- function(spe_vec){ return(Shannon.H(spe_vec) / log(length(spe_vec > 0))) } Pielou.J(a) Pielou.J(b) Pielou.J(c) |
Patrick指数、Shannon-Wiener指数、Simpson指数，Pielou ...
一个生态群落的多样性，有两个基本的指标。丰富度（richness），衡量一个生态系统有多少不同的物种均匀度（evenness），衡量生态系统中，不同物种之间数量的差异度另外还有个名词是丰度（abundance），是每个物种数 ......
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